1987 년 안과전문가 Aran Safir 와 Leonard Flom 은 먼저 홍채 이미지를 이용한 자동 홍채 인식 개념을 제시했지만 실제 응용 시스템을 개발하지는 않았다.
199 1 년, 미국 로스알라모스 국립연구소의 존슨은 문헌에 기재된 최초의 응용 시스템인 자동 홍채 인식 시스템을 구현했다.
1993 년 John Daugman 은 고성능 홍채 인식 프로토타입 시스템을 구현했습니다. 현재 대부분의 자동 홍채 인식 시스템은 Daugman 의 핵심 인식 알고리즘을 사용합니다.
1996 년 Richard Wildes 는 홍채 기반 인증 시스템을 성공적으로 개발했습니다.
1998 년 말 중국과학원 자동화연구소가 홍채 인식을 연구하기 시작했고, 2000 년 우리나라 자주지적재산권의 홍채 인식 시스템을 개발하는 데 성공했다.